קורס מזכירות רפואית מיועד לכל המעוניין לרכוש מקצוע רווחי ואחראי הכולל הקניית ידע עיוני ומקצועי נרחב בתחום הסיעוד והרפואה כמו גם הקניית מיומנויות ארגון וניהול משרדי בשירותי הבריאות. בנוסף, מתאים הקורס לבעלי ניסיון מעשי במזכירות רפואית המעוניינים לרכוש הסמכה המוכרת על ידי משרד התמ"ת. תנאי הקבלה לקורס כוללים 12 שנות לימוד, שימוש ותפעול בסיסי של מחשב ומעבר וועדת קבלה.
תכני הלימוד בקורס הינם מגוונים וכוללים נושאים כגון מבוא למדעי הרפואה, אנטומיה, פיזיולוגיה ,מיומנויות ארגון וניהול ,תקשורת בינאישית ומתן שירות , שימושי מחשב , סודיות ואתיקה מקצועית ,מציאת עבודה , כלים וטכניקות בניהול משרד ועוד. הלימודים בקורס כוללים הרצאות פרונטאליות, תרגול מעשי בתוכנות מחשב רלוונטיות והתנסות מעשית בבתי חולים ומוסדות רפואיים.
הלימודים בקורס הינם במתכונת דו שבועית בשעות הערב ונפרשים על פני 33 מפגשים בני ארבע שעות כל אחד. בנוסף, כוללים הלימודים התנסות במוסד רפואי והתמחות. בסיום הקורס, וכתלות במעבר הבחינה העיונית והבחינה המעשית, תתקבלנה תעודת גמר ותעודת מקצוע מטעם משרד התמ"ת.